公元1356年，朱元璋攻下集慶(南京)，改名應(yīng)天府。1357年采用謀士朱升提出的“高筑墻、廣積糧、緩稱(chēng)王”的建議，下令修筑應(yīng)天府城，并于1368年在此建都稱(chēng)帝，建立大明王朝。

明代南京都城始建于元朝至正二十六年(1366)八月，完工于明朝洪武十九年(1386)十二月，歷時(shí)二十年零四個(gè)月，是南京城市發(fā)展史上規(guī)模最大、最具特色的時(shí)期。明朝建造的南京都城，包括宮城、皇城、京城和外郭四圈城墻�，F(xiàn)存的南京城墻，即是明代的第三圈城墻——京城，它東傍鐘山，南憑秦淮，西據(jù)石頭(即清涼山、石頭城)，北控后湖(即玄武湖)，不僅包容了孫吳的石頭城、六朝建康都城、南唐金陵府城，而且將南唐都城之外北面的獅子山、雞籠山、覆舟山、富貴山、馬鞍山等諸山，統(tǒng)統(tǒng)圈入城內(nèi)，形成了三大功能區(qū)，即城東部新建的皇城區(qū)、城中部和南部原來(lái)的居民區(qū)及商業(yè)區(qū)以及城西北部擴(kuò)展的軍事區(qū)。

南京城墻長(zhǎng)達(dá)33.676公里，高度一般在14—21米之間，最高處達(dá)25米；頂部寬度7—12米，城基寬度10—18米不等。沿城有垛口(雉堞)13616個(gè)，高棚(堡壘)200座，均為御敵之用。明初建城時(shí)，共開(kāi)城門(mén)十三座，即正陽(yáng)門(mén)(今光華門(mén)，原有門(mén)券一道，月城一座)、通濟(jì)門(mén)(原有四券四道)、聚寶門(mén)(今中華門(mén)，有門(mén)券四道)、三山門(mén)(今水西門(mén)，原有門(mén)券四道，右邊水關(guān)一座)、石城門(mén)(今漢西門(mén)，有門(mén)券二道)、清江門(mén)(今清涼門(mén))、定淮門(mén)、儀鳳門(mén)(今興中門(mén)，城下原有水洞二座)、鐘阜門(mén)、盆川門(mén)、神策門(mén)(今和平門(mén)，有門(mén)券二道)、太平門(mén)、朝陽(yáng)門(mén)(今中山門(mén)，城下原有水關(guān)一座)。

《儒林外史》記載“三山聚寶臨通濟(jì)，正陽(yáng)朝陽(yáng)定太平，神策金川近鐘阜，儀鳳定淮清石城”，是按逆時(shí)針?lè)较蚺帕辛司┏鞘�三座城門(mén)的順序。清朝末年開(kāi)辟了草場(chǎng)門(mén)以后，又陸續(xù)于1909年開(kāi)豐潤(rùn)門(mén)(今玄武門(mén))，1921年開(kāi)海陵門(mén)(今挹江門(mén))，1926年開(kāi)雨花門(mén)，1929年開(kāi)武定門(mén)，1931年開(kāi)漢中門(mén)和新民門(mén)，1933年開(kāi)中央門(mén)，1952年開(kāi)解放門(mén)，共計(jì)增開(kāi)九門(mén)。但現(xiàn)存的明代城門(mén)只有聚寶門(mén)、石城門(mén)、神策門(mén)、朝陽(yáng)門(mén)(重修過(guò))和清涼門(mén)等五座。清末以后新開(kāi)的城門(mén)，也只存玄武門(mén)、挹江門(mén)、解放門(mén)及1991年新開(kāi)的集慶門(mén)等四座。

南京城墻的墻身結(jié)構(gòu)分為墻基、墻身、雉堞三個(gè)層次。大部分城墻都先用長(zhǎng)1米左右、寬0.7米、厚0.3米的花崗巖或石灰?guī)r的條石作基礎(chǔ)，上面再用規(guī)整統(tǒng)一的巨磚(一般長(zhǎng)0.4米、寬0.2米、厚0.1米)，壘砌內(nèi)外兩壁和頂部，內(nèi)外壁之間常用碎磚、礫石和黃土層層夯實(shí)，許多重要地段則內(nèi)外兩壁從頂?shù)降兹�部用大塊條石砌筑，或兩壁用條石砌筑，中間全用磚砌。整個(gè)墻體取梯形堆砌，下寬上窄，以保持平衡穩(wěn)定；城磚砌筑每層犬牙狀接榫相咬，增加內(nèi)部拉力；城墻基礎(chǔ)底部，一般深入地面以下2—5米，底腳寬于城墻1—2米，以保證城墻基牢固。

城墻頂部和內(nèi)外兩壁的磚縫里，都澆灌一種“夾漿”，系用石灰、糯米汁(或高果汁)或再加桐油摻和而成，凝固后粘著力很強(qiáng)，保持墻身經(jīng)久不壞。墻頂用磚鋪成地面并砌成雉堞，并安置石刻的泄水槽以排出雨水。墻基部分間隔設(shè)置排水洞，以排除城墻內(nèi)側(cè)的積水。

為確保都城安全，在秦淮河出入城墻處，各建水門(mén)一座，每座三道閘門(mén)，前后兩道是水閘，中間是固定式鐵柵，即今秦淮河南段的東水關(guān)和西水關(guān)。為減輕城墻跨河自重，東水關(guān)設(shè)有三十三座拱券，共分三層，中上二層似城門(mén)洞，下層流水，其中孔可以通船，設(shè)計(jì)結(jié)構(gòu)科學(xué)。此外，在玄武湖水入城處設(shè)武廟閘和太平門(mén)閘，前湖水入城處設(shè)半山園閘，琵琶湖水入城處設(shè)琵琶閘，東南護(hù)城河水入城處設(shè)銅心管閘，各閘均安置銅管或銅欞，能進(jìn)水而不能進(jìn)人，設(shè)計(jì)十分巧妙。

十三座城門(mén)上都建有敵樓，并設(shè)木城門(mén)、千斤閘各一道，以資防守。重要位置的城門(mén)，還增設(shè)道數(shù)不等的甕城，聚寶、通濟(jì)、三山三門(mén)各增三道甕城，石城門(mén)增兩道甕城。朝陽(yáng)門(mén)及神策門(mén)各增一道甕城�，F(xiàn)存甕城的只有南京城墻的南門(mén)即中華門(mén)(聚寶門(mén))，在所有城門(mén)中最為堅(jiān)固。城堡東西寬118．57米，南北進(jìn)深128米，高20．45米，總面積達(dá)15163平方米。城堡有一道主城，三道甕城，共設(shè)四道城門(mén)和四道千斤閘，城內(nèi)有兩條蹬道和一條馬道。城堡內(nèi)側(cè)共有27個(gè)藏兵洞，戰(zhàn)時(shí)可藏兵3000人以上。城堡頂部原建有重檐廡殿頂?shù)臄硺且蛔�，可供隙望，惜�?937年底被侵華日軍的炮火摧毀。

南京城墻所用巨磚，數(shù)量極大，質(zhì)量又高。明王朝動(dòng)員了南京工部、京師駐軍三衛(wèi)及長(zhǎng)江中下游的湖南、湖北、江西、安徽、江蘇等五省的33個(gè)府、9個(gè)州、148個(gè)縣及5個(gè)鎮(zhèn)負(fù)責(zé)燒制，由水路運(yùn)到南京。為了便于檢查質(zhì)量，明王朝還規(guī)定城磚上必須打印有造磚工匠和監(jiān)造官員的姓名，有的還印上制作的年月日，一當(dāng)發(fā)現(xiàn)燒制的城磚有質(zhì)量問(wèn)題，則立即追究責(zé)任，直至嚴(yán)加懲處。所以城磚質(zhì)量都很好，至今扣之清脆有聲。